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Expériences professionnelles

Depuis- Sep 2009 ATER MTI Université Paris Diderot - Paris 7, France Extraction de motifs fonctionnels dans les boucles protéiques Bioinformatique structurale, Biostatistiques Prédiction du volume de distribution de petites molécules Chemoinformatique, Drug Design Oct 2008 - Sep 2009 Stage Post-doctoral Centre for Drug Research Computational Drug Discover, Faculty of Pharmacy, University of Helsinki, Finland Structural bioinformatics for the design of novel drug scaffolds Drug Design, Bioinformatique structurale 2008-2005 Doctorat - Spécialité Analyse de Génome et Modélisation Moléculaire, Université Paris Diderot - Paris 7 Analyse de la structure des boucles protéiques: Développement d'une méthode d'extraction systématique de motifs récurrents au sein des régions en boucles Thèse effectuée sous la direction du Pr. AC Camproux à l'EBGM (Equipe de Bioinformatique et Génomique Moléculaire) Bioinformatique structurale, Biostatistiques Janvier-Juillet 2005 Stage de Master 2. EBGM (Equipe de Bioinformatique Génomique et Moléculaire, INSERM U726) Paris 7 Exploration de motifs structuraux répétes au sein des boucles protéiques Bioinformatique structurale, Biostatistiques Juillet 2004 Stage de maîtrise. Institut Jacques Monod Equipe de Modélisation en Biologie Intégrative Paris Etudes préliminaires sur les banques de données pour la notation des réseaux d'interaction protéines-protéines Bioinformatique Mars-Juin 2004 Moniteur d'informatique UFR de Biochimie de Université Paris 7 Juillet 2003 Stage de licence. EBGM (Equipe de Bioinformatique Génomique et Moléculaire, INSERM U346) Paris 7 Etudes d'un nouveau marqueur dans la maladie du Myélome multiple : Etudes statistiques Biostatistiques Janvier-Fevrier 2002 Stage de BTS. Laboratoire de Pharmaco-Toxicocinétique UPRES EA 3286 (Université Marseille-Aix2) Etude de l'influence des protéines C-MYC et FAS sur la sensiblité des cellules LoVo envers les fluoropyrimidines Enzymologie Juin 2001 Stage de BTS. Laboratoire de Pharmaco-Toxicocinétique UPRES EA 3286 (Universite Marseille-Aix2) Dosage de l'activité Thymidilate synthetase cytosolique Enzymologie

Encadrement de stagiaires

Mars-Juin 09 Virginie Martiny : M1 Biologie informatique l'Université Paris Diderot -Paris 7 Co-encadrement avec Dr. Henry Xhaard (CDR, University of Helsinki, Finland) Stage réalisé et encadré en Finlande QSPR modeling of the volume of distribution using the k-Nearest Neighborhood method Drug Design, QSPR Mars-Juin 08 Sébastien Lementex : M1 Biologie informatique l'Université Paris Diderot -Paris 7 Analyse de la redondance structurale d'une banque de motifs structuraux extraits des boucles protéiques et de la mise en place d'un site internet pour l'analyse des boucles par ces motifs structuraux Bioinformatique structurale, Biostatistiques Mars-Juin 08 Aline Gauliard : M1 Biologie informatique l'Université Paris Diderot -Paris 7 Co-encadrement avec Grégory Nuel (MAP5, CNRS UMR-8145, Université Paris Descartes Recherche de motifs structuraux fonctionnels dans les familles de SCOP Bioinformatique structurale, Biostatistiques Mars-Juin 07 Isabelle Pane : M1 Bio­informatique et Génomique de l'Université d'Evry Co-encadrement avec Anne-Claude Camproux (EBGM, Inserm U-726, Université Paris Diderot - Paris 7. Analyse de la variabilité structurale des séquences protéiques à l'aide d'un alphabet structural. Bioinformatique structurale, Biostatistiques

Formation

2008-2005 Doctorat Analyse de Génome et Modélisation Moléculaire, Université D. Diderot Paris 7 Thèse soutenue le 15 septembre 2008- Mention Très Honorable Téléchargement du manuscrit (version pdf) 2005-2004 Master 2 de recherche Sante Publique et Management de la Santé Mention Biomathématiques (Université Paris 6) 2004-2003 Maîtrise de Biochimie Structurale (Université Paris 7) 2003-2002 Licence de Biochimie (Université Paris 7) 2002-2000 BTS Biotechnologie (Lycée Lumière Luxeuil-les-Bains) 2000-1999 APEMK (Année Préparatoire aux études de Kinésitherapeute (Université Franche-Comté) 1999-1998 Baccalauréat Scientifique Option mathématique (Lycee Paul Emile Victor Champagnole)