Leslie Regad
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Oral Communications
2016
1. Étude des mécanismes de résistance de la protéase du VIH-2 face aux inhibiteurs de la protéase de VIH-1 à l'aide des approches In Silico.
Journée Scientifique de l'UFR SdV 2016 Université Paris Diderot, France 14/02/2016.
2013
Comparative analysis of ATP-binding sites of type II topoisomerase: Preliminary studies for the development of M. tuberculosis DNA gyrase inhibitors
Leslie REGAD et Claudine Mayer.
Journée Scientifique de l'UFR Sciences du Vivant, Université Paris Diderot Paris, France. 3/12/2013.
Characterization of pocket-ligand interactions in the perspective of prediction of drug side effect
GGMM 2013 Saint-Pierre d'Oléron, France 21-23/05/2013.
2012
SA-Mot: a new webserver for the extraction of motifs of interest from protein loops
JOBIM Rennes, France, 03-06/07/2012.
2011
Simplification of three dimensional structures using bioinformatic approaches : extraction of structural and functional motifs
Symposium of Drug Design Seoul, Corée, 22/11/2011.
A statistic analysis of interactions between serine proteases and inhibitor peptides
43ème Journées de Statistique Gammarth, Tunisie, 23-27/05/2011.
Use of statistical approach to detect functional motifs in protein loops
43ème Journées de Statistique Gammarth, Tunisie, 23-27/05/2011.
Analyses statistiques des boucles protéiques : de la structure à la fonction
Séminaire URGV Evry, France, 13/04/2011.
2010
Structural-alphabet motifs in protein loops : from structure to function
Department of Chemistry, University of Timisoara Roumanie, novembre 2010.
Structural-alphabet motifs in protein loop structures: from structure to function
Journées Ouvertes de Biologie Informatique Mathématiques (JOBIM), Montpellier, France, 8 septembre 2010
Analyse de la structure des boucles protéiques à l'aide d'un alphabet structural : identification de motifs impliqués dans la structure et la fonction des protéines
Institut de pharmacologie moleculaire et cellulaire , Sophia Antipolis, 27 avril 2010
Analyse de la structure des boucles protéiques par une approche basée sur un alphabet structural
Séminaire UMPMC, Paris, 8 avril 2010
2009
Analyse statistique des boucles protéiques : développement d'une méthode d'extraction systématique de motifs récurrents au sein des régions en boucles
Soutenance de thèse, Université Paris Diderot - Paris 7 (France), 15 spetembre 2008
Utilisation d'une approche statistique pour extraire des motifs particuliers dans les boucles protéiques simplifiées par un alphabet structural
Séminaires de l'ABI (Atelier de Bioinformatique)
2007
Etude des caractéristiques des motifs structuraux extraits des boucles protéiques.
Journées de rentrées, Paris (France) 27-28 septembre 2007.
Biological features of over-represented structural motifs in protein loops.
Journées Ouvertes de Biologie Informatique Mathématiques (JOBIM), Marseille (France), 10-12 juillet 2007. Présentation courte
2006
Analysis of Loops Using a Structural Alphabet: Identification of non Random Motifs.
IEEE Symposium on Computational Intelligence in Bioinformatics and Computational, Toronto (Canada),28-29 septembre 2006
Identification of non Random Motifs in Protein Loops Using Structural Alphabet.
Journées Ouvertes de Biologie Informatique Mathématiques (JOBIM), Bordeaux (France), 05-07 juillet 2006.
Poster : 32 posters
2015
On the Interest of Semi Supervised Approaches with Spatial Dependence in Structural Alphabet Encoding
Allam I., Flatters D., Regad L. , Camproux A.C., and Nuel G. the ISMB-ECCB 10-14/07/2015, Dublin, Ireland
A Tool initiating a drug-design pipeline: PockDrug-server, a web server to predict pocket druggability
Abi Hussein H., Borrel A., Geneix A., Petitjean M., Regad L. , Camproux A.C. the ISMB-ECCB 10-14/07/2015, Dublin, Ireland
PockDrug-Server : a web server for predicting pocket druggability
Abi Hussein H., Borrel A., Geneix A., Petitjean M., Regad L. , Camproux A.C. JOBIM 06-09/07/2015, Clermont-Ferrand, France
Salt bridges in protein ligand interactions
Borrel A., Regad L.,Camproux A.C., Xhaard H. JOBIM 06-09/07/2015, Clermont-Ferrand, France
SA conf: a tool to analyse the sequence and structural variability of a conformer set. Illstration using the uPA catalytic domain
Regad L., J.B. Chéron, C. Senac, D. Flatters, Camproux A.C. JOBIM 06-09/07/2015, Clermont-Ferrand, France
SA-conf : un outil d'analyse et de comparaison de la variabilité de séquence et de structure d'un ensemble de conformères d'une protéine
Regad L., J.B. Chéron, C. Senac, D. Flatters, Camproux A.C. 19ème GGMM 26-28/05/2015, Sète, France
Phosphate and ribose structural isosteric replacement in the Protein Data Bank
Zhang Y., Borrel A., Regad L.,Boije Af Gennäs G., Yli- Kauhaluoma J. and Xhaard H. XXIIème journée des jeunes chercheurs SCT 04-06/02/2015, Romainville, France
2014
Phosphate and ribose structural isosteric replacement in the Protein Data Bank
Zhang Y., Borrel A., Regad L.,Boije Af Gennäs G., Yli- Kauhaluoma J. and Xhaard H. the 13th ECCB 07-10/09/2014, Strasbourg, France
Druggability prediction performances related to different pocket estimations
Borrel A., Regad L., Xhaard H., Petitjean M. and Camproux A.C. the 13th ECCB 07-10/09/2014, Strasbourg, France
Effects of the pocket estimation algorithms in one pocket-ligand complex classification
Caumes G., Abi Hussein H., Chéron J.B., Camproux A.C. and Regad L. the 13th ECCB 07-10/09/2014, Strasbourg, France
Druggability prediction performances related to different pocket estimations
Borrel A., Regad L., Xhaard H., Petitjean M. and Camproux A.C. Chemoinformatics Strasbourg Summer School 23-27/06/2014, Strasbourg, France
Salt bridges in protein-ligand interactions
Borrel A., Regad L.,Camproux A.C., Xhaard H. Spring School in Computational Chemistry 18-22/04/2014, Espoo, Finland
2013
Salt bridges in protein-ligand interactions
Borrel A, Regad L , Camproux AC,Xhaard H. Winter School - National Doctoral Programme in Informational and Structural Biology (ISB) 9-12/12/2013, Saariselkä - Finland
Comparison of the inhibitor-binding sites of type II topoisomerase
Chéron JB, Borrel A, Petitjean M, Mayer C, Camproux AC, Regad L. 6ème journées de la SFCi 10-11 octobre 2013, Nancy (France)
Druggability pocket prediction from apo and holo proteins.
Borrel A, Regad L , Xhaard H, Petitjean M, Camproux AC. JOBIM 2013 01-04 Juillet 2013, Toulouse (France)
Modeling the pocket-ligand pairs space in a perspective of a better characterisation of the protein-ligand interactions.
Regad L , Flatters D, Geneix C, Camproux AC. JOBIM 2013 01-04 Juillet 2013, Toulouse (France)
Bases structurales de l'activité oxydase de la flavoprotéine AnaB impliquée dans la biosynthèsede la cyanotoxine anatoxine-a.
Moncoq K, Regad L , Mann S, Méjean A, Ploux O. Congrès de l'association française de cristallographie (AFC) 02 au 05 Juillet 2013, Bordeaux (France)
Statistical models predicting the "druggability" of protein pockets
Borrel A, Regad L, Xhaard H, Petitjean M, Camproux AC Journées des Jeunes chercheurs, Société de Chimie Thérapeutique 07-08 février 2013 Rennes (France)
2012
Towards improving docking-scoring functions in structure-based virtual screening
Montout L, Petitjean M, Moroy G, Regad L, Camproux AC. JOBIM, Rennes (France), 03-06 juillet 2012
Characterization of inhibitor binding sites of different sub-families of Serine Proteases
Regad L, Xhaard H, Camproux AC. 3rd Strasbourg Summer School on Chemoinformatics , Strasbourg (France), 25-29 juin 2012
2011
A structural bioinformatics study of peptides and small molecules complexed to trypsin-like serine proteases
Nuel G, Regad L, Turku A, Xhaard H. FinMedChem , Helsinki (Finland), 15-16 septembre 2011
2010
Exact distribution of a pattern in a set of random sequences
Nuel G, Regad L, Martin J, Camproux AC. Journée Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques , Montpellier (France), 7-10 septembre 2010
Prediction of patterns of interest from protein primary sequence through structural alphabet
Reynès C, Regad L,Sabatier R, Camproux AC. Journée Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques , Montpellier (France), 7-10 septembre 2010
2009
A new method to predict 3D structure for protein loops
Reynès C, Regad L,Sabatier R, Camproux AC. 17th Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB) & 8th European Conference on Computational Biology (ECCB) , Stockholm (Suède), 27 juin - 2 juillet 2009
Analysis of loop structure and function using structural motifs
Regad L, Martin J, Nuel G, Camproux AC. VIII European Symposiom of The Protein Society , Zurich (Suisse), 14-18 juin 2009
2008
Extraction of important structural motifs from protein loops using statistical method and structural alphabet approach
Regad L, Martin J, Nuel G, Camproux AC. 7th European Conference on Computational Biology , Cagliari (Sardaigne-Italie), 22-26 septembre 2008
2007
Specificity of exceptional structural motifs within protein loops
Regad L, Martin J, Debret G, Nuel G, Camproux AC. 15th Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB) & 6th European Conference on Computational Biology (ECCB) , Vienne (Autriche), 21-25 juillet 2007
A structural approach to extract and analyse exceptional motifs within loops.
Regad L, Martin J, Debret G, Nuel G, Camproux AC. 3DSIG 2007 ISMB satellite meeting: Structural Bioninformatics and computational Bioophysics, Vienne (Autriche),19-20 juillet 2007
Biological features of over-represented structural motifs in protein loops.
Regad L, Martin J, Debret G, Nuel G, Camproux AC. Journée Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques , Marseille (France), 10-12 juillet 2007
Local deformations of the loop involved in the dimeric interaction in sHSP proteins using classical and structural alphabet approaches.
Regad L, , Camproux AC, Martin J, Kolski A, Etchebest C, Flatters D. Journée Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques , Marseille (France), 10-12 juillet 2007
2006
Analyse des boucles protéiques à l'aide d'un alphabet structural. Extraction et étude de motifs récurrents au sein des boucles.
Regad L., Guyon F., et Camproux A.C. Journées de Bioinformatiques, Paris (France), Janvier 2006
2005
Développement de méthodes bioinformatiques pour l\'extraction de motifs structurés au sein des boucles protéiques. [PDF]
Regad L, Guyon F, Bahrini H, Hazout S, Camproux AC. Journée Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques , Lyon (France),Juillet 2005